Bash - obliczenia kwantowo-chemiczne
: 14 lipca 2009, 18:33
Witam.
Muszę wykonać kilka obliczeń kwantowo - chemicznych. W tym celu stworzyłem dwa skrypty. Jedne z nich generuje pliki wejściowe i skrypt startowy, który odpala programy do obliczeń, w odpowiednich podkatalogach. Drugi skrypty służy do wrzucania do kolejki skryptów startowych w poszczególnych podkatalogach. Skrypt wygląda tak:
I tu się pojawia problem. Bo puszczając obliczenia w ten sposób wyskakuje mi taki o to błąd:
to jest oczywiście fragment stderr. Ciekawe jest to, że robiąc to ręcznie wszystko działa bez zarzutów. Może któryś z szanownych forumowiczów wie jak ugryźć ten problem.
Pozdrawiam,
sunday
Muszę wykonać kilka obliczeń kwantowo - chemicznych. W tym celu stworzyłem dwa skrypty. Jedne z nich generuje pliki wejściowe i skrypt startowy, który odpala programy do obliczeń, w odpowiednich podkatalogach. Drugi skrypty służy do wrzucania do kolejki skryptów startowych w poszczególnych podkatalogach. Skrypt wygląda tak:
Kod: Zaznacz cały
#!/bin/bash
for dlugosc in 1.60 1.61 1.62 1.63 1.64 1.65 1.66 1.67
do
cd 'dlugosc_'$dlugosc
qsub -N 'FeO_5_dlugosc_'$dlugosc -q huge_serial ./RUN.sh
cd ..
done
Kod: Zaznacz cały
/usr/local/molcas/molcas70/bin/seward.exe: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
Pozdrawiam,
sunday