Bash - obliczenia kwantowo-chemiczne

Potrzebujesz pomocy z C, C++, perl, python, itp.
sunday85
Posty: 8
Rejestracja: 27 lutego 2009, 20:20

Bash - obliczenia kwantowo-chemiczne

Post autor: sunday85 »

Witam.

Muszę wykonać kilka obliczeń kwantowo - chemicznych. W tym celu stworzyłem dwa skrypty. Jedne z nich generuje pliki wejściowe i skrypt startowy, który odpala programy do obliczeń, w odpowiednich podkatalogach. Drugi skrypty służy do wrzucania do kolejki skryptów startowych w poszczególnych podkatalogach. Skrypt wygląda tak:

Kod: Zaznacz cały

#!/bin/bash

for dlugosc in 1.60 1.61 1.62 1.63 1.64 1.65 1.66 1.67
do

cd 'dlugosc_'$dlugosc
qsub -N 'FeO_5_dlugosc_'$dlugosc -q huge_serial ./RUN.sh
cd ..

done
I tu się pojawia problem. Bo puszczając obliczenia w ten sposób wyskakuje mi taki o to błąd:

Kod: Zaznacz cały

/usr/local/molcas/molcas70/bin/seward.exe: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Command exited with non-zero status 127
to jest oczywiście fragment stderr. Ciekawe jest to, że robiąc to ręcznie wszystko działa bez zarzutów. Może któryś z szanownych forumowiczów wie jak ugryźć ten problem.

Pozdrawiam,
sunday
leon1313
Posty: 13
Rejestracja: 20 września 2007, 03:42

Post autor: leon1313 »

Zmienne środowiskowe?
ODPOWIEDZ