Wykonaj to poprzez dpkg-reconfigure bootsplash (lub bootsplash-theme-cośtam). Jeżeli masz bootsplasza w wersji >3.1.6 to nie powinno być problemu (ale gwarancji nie daje, nie używam initrd)
Kompilujesz kernela z obsługa i/o i systemem plików na stałe. Wtedy możesz zrobić obraz ramdysku tylko dla bootsplasha - to jest najbardziej niezawodna metoda.
Ale skrypty konfiguracyjne motywu bootsplasha powinny go dopisać do istniejącego initrd .