Rzeczywiście bezmyślnie dopisałem repozytoria nie sprawdzając, że się wersja stabilna zmieniła, dziękuję za podpowiedzi ale mam jeszcze jedno pytanie.
Według podręcznika systemowego robiąc: apt-get dist-upgrade
podnoszę wersję całego systemu ale co w przypadku kiedy chce podnieść wersję ...

Mam problem z uruchomieniem wersji php z 5.2.6 do 5.3

Dodałem do /etc/apt/sources.list wpisy:
deb http://php53.dotdeb.org stable all
deb-src http://php53.dotdeb.org stable all
Importowałem klucz:
wget http://www.dotdeb.org/dotdeb.gpg
cat dotdeb.gpg | sudo apt-key add -
robie:
apt-get update ...